接下来,按照两国商定的程序,印度将在两个月内,撤回所有驻扎在马尔代夫的89名军人。印军人数不多,但凭借着这些印军,以及印军操纵的军机,印度实际控制着马尔代夫的国防。现在,印度军人不得不撤走了,但印度人还在。马尔代夫的两架军用直升机和一架军用固定翼飞机,将改由印度文职人员操作。
3月12日,马尔代夫传出消息称,首批驻扎在马尔代夫的印度军事人员约25人已经撤离。早在2月18日,马尔代夫总统穆伊兹就公开表示,根据该国和印度签署的协议,印度必须在5月10日前,将所有印方军事人员撤出马尔代夫。在僵持近一个月的时间后,印度总理莫迪下令撤军。这意味着在中方出手反制后,印度终于认清了形势。消息称,自3月4日起,解放军代表团就先后前往马尔代夫、斯里兰卡和尼泊尔进行为期10天的访问。外界认为,这是中方对印度作出的反制措施。